Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CENPNQ96H22 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms