Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms