Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM12Q96EX1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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