Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms