Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIRT1Q96EB6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms