Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCTD12Q96CX2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms