Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C8orf44Q96CB5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms