Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNDC1Q96C34 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms