Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms