Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PALLDQ8WX93 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALLDQ8WX93 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms