Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRRN4Q8WUT4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRN4Q8WUT4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRN4Q8WUT4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRRN4Q8WUT4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms