Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIEQ8NEW7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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