Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C17orf47Q8NEP4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C17orf47Q8NEP4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms