Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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TTC21AQ8NDW8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTC21AQ8NDW8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTC21AQ8NDW8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
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