Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms