Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GDPD1Q8N9F7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDPD1Q8N9F7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GDPD1Q8N9F7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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