Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC89Q8N998 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms