Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC155Q8N6L0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms