Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC103Q8IW40 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC103Q8IW40 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms