Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNMB4Q86W47 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms