Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATG4DQ86TL0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms