Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC29A4Q7RTT9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms