Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC80Q76M96 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms