Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FAM43BQ6ZT52 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms