Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00299Q6ZSB3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00299Q6ZSB3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms