Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms