Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCBE1Q6UXH8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms