Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OPN5Q6U736 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OPN5Q6U736 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms