Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TSSK4Q6SA08 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms