Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRFN4Q6PJG9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRFN4Q6PJG9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms