Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms