Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms