Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIGD3Q6B0B8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms