Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEF8Q5VWM4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms