Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDSS1Q5T2R2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDSS1Q5T2R2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms