Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDLIM3Q53GG5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDLIM3Q53GG5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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