Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC153Q494R4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC153Q494R4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms