Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIN7

RGL3, Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGL3Q3MIN7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGL3Q3MIN7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms