Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LETM2Q2VYF4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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