Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms