Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSPP1Q1MSJ5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms