Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms