Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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PTPROQ16827 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPROQ16827 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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