Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCK2Q16822 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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