Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCSK7Q16549 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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PCSK7Q16549 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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PCSK7Q16549 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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PCSK7Q16549 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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PCSK7Q16549 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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PCSK7Q16549 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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PCSK7Q16549 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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