Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1EQ15878 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms