Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC85BQ15834 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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