Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNA2Q15822 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA2Q15822 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms