Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SPEGQ15772 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms