Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF1AQ15573 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms